《三国志12》这次革新最大的便是战斗系统，不再是以往传统的战棋模式，而是采用全新的RTS（即时策略）模式。部队战斗不再是你来我往的回合制，而是双方即时进行的。由于游戏的快节奏（和省去了交替等待的时间）使得一场游戏的时间变得更短，即时战略游戏比回合制游戏更适合联机对战，这个是光荣考虑采用这种战斗模式的主要原因。《三国志12》的即时战略模式使玩家不仅要有整体大局战略思维，同时对战局变化也有微观的战术操作。排兵布阵不再由格子来决定，而且交给玩家实时操作。如何短时间内实现冲突中保持优势兵科克制对手和战法的最大影响，反应力将成为玩家间对抗除了传统战略思想要求外决定胜负的另一重要因素。

战斗界面标示介绍

    《三国志12》对战β测试版中一场战斗只要满足以下任一条件，即可判定胜负：
    1.对阵双方本阵先被对方攻破（本阵兵力为0）为负；
    2.对阵双方兵力先全部消耗完者为负；
    3.对阵双方武将先被全部讨死导致无武将复活者为负；
    4.500秒限制时间内上述条件均未满足，总兵力剩余最少者为负。

    首先说游戏中的兵力，《三国志12》对战β测试版战斗的初始总兵力是你所有参与战斗的出阵武将的最大兵力加上本阵50000预备兵力之和。出阵武将在战斗中只要兵力没有全部损失光，即可移动回本阵，通过消耗本阵预备兵的方式补充自身兵力，随时出击再战。
    但如果出阵武将在战斗中兵力损失殆尽，变成体力100的武将状态，并且开始不受控制地自动移动回归本阵。如果能在体力降低为0前回归本阵，则可以强制休息一段时间后，重新通过消耗本阵预备兵的方式补充自身兵力出击；反之，如果在回归本阵的路上体力降低为0，则被判定为讨死状态，这局将无法复活出击。